UG环球双十一?科研不缺席 | 功效性基因筛选文库
01
CRISPR/Cas9 gRNA文库
CRlSPR/Cas9通过gRNA指导Cas9核酸酶对靶标基因举行DNA修饰,,以此造成基因的功效突变或缺失。。。。。CRlSPR/Cas9 gRNA文库筛选就是使用CRlSPR/Cas9手艺建设哺乳动物全基因组突变库或者与某类功效相关的基因突变体库,,通过功效性筛选和富集以及随后的PCR扩增和深度测序剖析,,掘客与筛选表型相关的基因。。。。。gRNA文库是药物筛选或靶向筛选特定通路的理想工具,,gRNA文库的建设将在功效基因筛选、疾病机制研究及药物研发等方面施展主要的功效。。。。。
常用单载体文库骨架示意图:
常用双载体文库骨架示意图:
02
CRlSPR/Cas9 gRNA文库筛选流程
1
gRNA文库选择
首先选择所需gRNA文库。。。。。包括全基因组库和定制文库,,接纳单/双慢病毒载体,,这两种模式载体均携带有特另外抗性筛选标记。。。。。
2
gRNA文库扩增
gRNA载体构建完成后混淆成一个 pool(即载体混淆库),,随后将载体混淆库举行扩着述育,,最后抽提质粒,,即获得了扩增后的载体混淆库,,也就是文库。。。。。
3
gRNA文库慢病毒包装
扩增后的gRNA文库举行慢病毒的包装,,获得混淆型慢病毒库,,每个慢病毒载体携带单个gRNA。。。。。
4
gRNA文库筛选
对筛选的目的细胞举行病毒熏染预实验。。。。。慢病毒库以较低的 MOI 值熏染细胞(确保每个细胞最多进入一个慢病毒),,随后凭证实验目的而对细胞接纳响应的处置惩罚,,最后经由差别的筛选方法富集细胞。。。。。
5
PCR扩增和NGS测序
对富集下来的细胞举行PCR 扩增,,该扩增片断包括载体所携带的 gRNA 序列,,通事后续的 NGS 测序,,我们可以获得富集细胞中 gRNA 的富集度,,从而寻找到响应的基因,,这些基因很有可能加入药物作用历程,,因此可作为深入研究的待选基因。。。。。
03
UG环球生物文库信息
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