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文献速递 | 转录组多组学在肿瘤研究中的应用

时间:2023-08-28 热度:

本期收录了近期关于转录组多组学手艺在癌症研究中的应用相关高分文章。。。。 。


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1 .人脂肪间干细胞外泌体可以抑制PI3K/Akt/mTOR通路和重塑胆碱代谢改善肝纤维化


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文章问题:Exosomes derived from human adipose mesenchymal stem cells ameliorate hepatic fibrosis by inhibiting PI3K/Akt/mTOR pathway and remodeling choline metabolism

揭晓期刊:Journal of Nanobiotechnology

影响因子:10.2

中科院分区:1区

揭晓时间:2023.1

  • 摘要

肝纤维化是一种慢性肝病,,,,,,现在,,,,,,尚无有用的肝纤维化标准治疗法。。。。 。研究批注人脂肪间充质干细胞(hADMSCs-Exo)的外泌体对肝脏疾病显示出显著的治疗作用,,,,,,本文研究了hADMSCs-Exo在体外和体内的抗纤维化功效,,,,,,并通过转录组学和代谢组学剖析确定了主要的代谢转变和详细机制。。。。 。研究发明hADMSCs-Exo可以通过加重细胞凋亡和阻断G1期来抑制活化的肝星状细胞的增殖,,,,,,在体外有用抑制促纤维化卵白和上皮到间充质转化(EMT)的表达。。。。 。别的,,,,,,在肝硬化小鼠模子中,,,,,,它可以显着阻断胶原沉积和EMT历程,,,,,,改善肝功效并镌汰肝脏炎症。。。。 。组学剖析批注,,,,,,hADMSCs-Exo抗肝纤维化的要害机制是抑制PI3K/AKT/mTOR信号通路,,,,,,影响脂质代谢中代谢产品的转变,,,,,,主要调理胆碱代谢。。。。 。由hADMSCs-Exo激活的CHPT1增进了囊泡膜的形成和维持。。。。 。研究批注,,,,,,hADMSCs-Exo可以削弱肝星状细胞活化并抑制肝纤维化的希望,,,,,,这说明hADMSCs-Exo具有治疗肝纤维化和其他顽固慢性肝病的重大潜力。。。。 。

 

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2 .通过构立功效基因和代谢产品的交互网络,,,,,,展现诱导结直肠癌细胞迁徙的相关细胞机制

 


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文章问题:Constructing interactive networks of functional genes and metabolites to uncover the cellular events related to colorectal cancer cell migration induced by arsenite

揭晓期刊:Environment International

影响因子:11.8

中科院分区:1区

揭晓时间:2023.4

  • 摘要

(iAsIII)诱导的肿瘤细胞迁徙与癌症的生长亲近相关。。。。 。然而,,,,,,袒露于iAsIII的迁徙性人类细胞的转录组和代谢特征未见其报道。。。。 。在此,,,,,,我们接纳了多组学要领来构建袒露于iAsIII的人类结直肠癌(DLD-1)细胞的功效基因和代谢物的互动网络。。。。 。研究批注在iAsIII处置惩罚后,,,,,,ZEB1和SLUG卵白的表达显着上调,,,,,,而CRB2的表达则下调(P < 0.05),,,,,,批注上皮细胞向间质转化(EMT)的最先。。。。 。同时,,,,,,在iAsIII处置惩罚下,,,,,,整合素和胶原卵白介导的生物粘附力被SLUG增强。。。。 ;;;;;;式鹗綦拿福∕MP)基因的表达受到iAsIII的增进,,,,,,别的,,,,,,这些基因具有降解细胞外基质的功效。。。。 。谷氨酰胺的代谢会受到iAsIII的滋扰,,,,,,而增补谷氨酰胺又能有用地增进DLD-1细胞的运动。。。。 。总而言之,,,,,,iAsIII可以通过一系列的细胞运动增进DLD-1细胞迁徙,,,,,,包括EMT激活、细胞粘附性改变、MMP依赖性基质降解,,,,,,同时陪同着谷氨酰胺的代谢。。。。 。

 

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.类维生素A在天冬酰胺酶相关性胰腺炎中的治疗作用



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文章问题:A systems approach points to a therapeutic role forretinoids in asparaginase-associated pancreatitis

揭晓期刊:Science Translational Medicine

影响因子:17.1

中科院分区:1区

揭晓时间:2023.3

  • 摘要

凭证胰腺炎威胁生命并导致大宗殒命,,,,,,急性淋巴细胞白血。。。。 。ˋLL)是儿童和青少年最常见的癌症,,,,,,天冬酰胺酶是目今治疗ALL的药物之一。。。。 。然而,,,,,,治疗历程中保存多种药物不良反应,,,,,,其中最典范的就是天冬酰胺酶相关性胰腺炎(AAP),,,,,,本研究接纳多组学要领来确定影响天冬酰胺酶相关性胰腺炎(AAP)的因素。。。。 。转录组数据剖析批注:天冬酰胺酶诱导的基因特征可能会被维甲酸(维生素A及其类似物)逆转。。。。 。别的,,,,,,我们还对24例爆发胰腺炎的ALL受试者(患者)和26例未爆发胰腺炎的ALL受试者(比照)在一次天冬酰胺酶袒露前后的血浆样本举行了周全代谢组学筛查。。。。 。效果显示,,,,,,病例的血浆中的类胡萝卜素含量低于比照组。。。。 。对30天膳食纪录显示,,,,,,患者从膳食中摄入的维生素A少于比照组。。。。 。在小鼠中,,,,,,仅给予天冬酰胺酶就足以镌汰循环和肝脏中的视黄醇。。。。 ;;;;;;谡庑┦,,,,,,可以以为循环中的类视黄醇可;;;;;;ひ认傺字,,,,,,而天冬酰胺酶可镌汰循环中的类视黄醇。。。。 。别的,,,,,,我们还发明,,,,,,当膳食中维生素A摄入量镌汰时,,,,,,AAP更易爆发。。。。 。

 

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参考文献

Zhang Z, Shang J, Yang Q, Dai Z, Liang Y, Lai C, Feng T, Zhong D, Zou H, Sun L, Su Y, Yan S, Chen J, Yao Y, Shi Y, Huang X. Exosomes derived from human adipose mesenchymal stem cells ameliorate hepatic fibrosis by inhibiting PI3K/Akt/mTOR pathway and remodeling choline metabolism. J Nanobiotechnology. 2023 Jan 25;21(1):29. doi: 10.1186/s12951-023-01788-4. PMID: 36698192; PMCID: PMC9878808

Zhang R, Sun J, Tu L, Lu W, Li Y, Luan T, Chen B. Constructing interactive networks of functional genes and metabolites to uncover the cellular events related to colorectal cancer cell migration induced by arsenite. Environ Int. 2023 Apr;174:107860. doi: 10.1016/j.envint.2023.107860. Epub 2023 Mar 21. PMID: 36989763.

Tsai CY, Saito T, Sarangdhar M, Abu-El-Haija M, Wen L, Lee B, Yu M, Lipata DA, Manohar M, Barakat MT, Contrepois K, Tran TH, Theoret Y, Bo N, Ding Y, Stevenson K, Ladas EJ, Silverman LB, Quadro L, Anthony TG, Jegga AG, Husain SZ. A systems approach points to a therapeutic role for retinoids in asparaginase-associated pancreatitis. Sci Transl Med. 2023 Mar 15;15(687):eabn2110. doi: 10.1126/scitranslmed.abn2110. Epub 2023 Mar 15. PMID: 36921036; PMCID: PMC10205044.


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